МБАЛ Централ Хоспитал откри Отделение по Микробиологична лаборатория, което има за цел да извършва специализирани лабораторни изследвания и регистриране и управление на микробната резистентност. Контролът на резистентността включва фокусиран мониторинг на епидемии и превантивни мерки за цялата болница и отделенията.
Микробиологията на МБАЛ Централ Хоспитал разполага със съвременна лаборатория и прави следните микробиологични изследвания: